Аспирантура открыта в 1995 году. Подготовка аспирантов ведется по специальности 10.02.22: Языки народов зарубежных стран Европы, Азии, Африки и аборигенов Америки и Австралии (финно-угорские и самодийские языки) на обеих кафедрах факультета.
В 2003 году начал работу Диссертационный Совет по присуждению ученой степени кандидата филологических наук (пред. Зайков П.М.)
Преподаватели и аспиранты факультета работают над диссертациями по следующей тематике:
- Назарова Л.Н. «Поэзия Я. Ругоева»
- Филиппова Е.В. «Суффиксальное и именное словообразование в карельском языке»
- Тарасюк М.А. «Название растений в карельском языке».
- Рудакова С.В.. «Карельские христианские личные имена».
- Логинова Е.В. «Лингвистическое изучение ценностных понятий духовной культуры: концепт "интеллект человека" в финской языковой картине мира»
- Анчукова Ю.С. «Концепт «труд/лень» в финской языковой картине мира»